注意一、鸡腿菇会出现头潮菇太密，转期困难。头潮菇多个体小，甚至成丛的菇蕾将覆土掀起，造成大批小菇因脱离料面死亡，难出二潮菇。
形成的原因：菌棒过密，或菌棒过长，料层过厚。
解决办法：拉大菌棒间距至2-3cm，并用土将菌棒间缝隙填实，或把菌棒菇切成二段，卧放出菇。
注意二、鸡腿菇种植会出现出菇不在床面。床面出菇极少，而四周土埂出菇较多。
形成原因：覆土厚度不当，床土干而散，四周土层较湿。
解决办法：覆土不超过3cm，全床覆土含水量要均匀，并控制在20%-30%之间。
注意三、鸡腿菇在种植前期会出现菌丝“冒土“。菌丝冒出床面，甚至形成菌被。
形成的原因：菌丝徒长。
解决办法：当菌丝快长到床面时，加强通风，使床土表面干燥，促使菌丝向生殖生长转化。如果是轻微冒菌丝，可加强通风，床面撒草木灰即可。如果菌丝形成菌被，可用刀划掉，挑掉菌块，喷打重水，增加通风，床面上补换细土。
注意四、鸡腿菇在种植过程中会大量发生“红头菇“。菌盖鳞片呈铁锈色，但不深入菌肉，不影响生长发育。
形成的原因：床料和空气湿度大，光线不适宜。
解决办法：当子实体出土后，喷水必须结合进行通风，不喷关门水，以保持菇体表面无水和有适宜的光照强度。
注意五、在鸡腿菇栽培中会出现鸡爪菇。菇体丛基部长出3-5个分枝似鸡爪褐色。
形成的原因：高温高湿，菌丝受土层杂菌侵染引起变态或病态。
解决办法：保持床料和空气适宜的湿度，搞好环境卫生，覆土经灭菌后再行使用。
